Jeszcze pytanie: czy chodzi o wiadomości w formacie HTML? Jeśli tak, to tutaj mogą chyba być kłopoty. Zdaje się, że były zgłaszane jakieś błędy, ale nie pamiętam której wersji to dotyczyło.
Kodowanie transportowe to sposób zapisu znaków tak, aby mogły być przesłane jako zwykły tekst ASCII (czyli o kodach znaków z przedziału 32...127). Znaki o innych kodach są zapisywane w specjalny sposób: najczęściej stosowane kodowanie to BASE-64 lub Quoted-Printable. Domyślne ustawienia stosowane przez The Bat! raczej działają poprawnie, a można je zmienić we właściwościach konta w sekcji "Zarządzanie pocztą".