Niestety, automatyzacja odpowiedzi nie jest w ogólnym przypadku najlepszym rozwiązaniem. Proponuję automatyzację częściową, tzn. włączenie w Opcjach filtru wysyłki utworzonej wiadomości Do kolejki wysyłkowej. Wówczas będziesz mogła przejrzeć utworzone automatycznie wiadomości i usunąć te, które są odpowiedzią na autoresponder.
Drugi sposób to zawężenie kryterium filtru - ale to nie będzie działać zawsze. Po prostu należałoby dodać jeszcze jeden warunek, który sprawdzałby w treści wiadomości z obcego autorespondera obecność (a raczej brak obecności) jakiejś charakterystycznej frazy, wstawianej przez Twój filtr. Oczywiście, to jest najłatwiejsze do ustawienia w przypadku kilku korespondentów, ale trudno tu o uogólnienie.
Lepszy chyba będzie pierwszy sposób i ręczne przeglądanie odpowiedzi przed wysyłką.